Os lisossomos não estão associados à degradação de substâncias nocivas ou que não são mais necessárias à célula.
Os lisossomos são organelas que contêm enzimas digestivas. Eles decompõem resíduos, como peças celulares desgastadas, e os reciclam em materiais úteis. Os lisossomos também desempenham um papel na digestão dos alimentos. Eles se fundem com os vacúolos alimentares e decompõem os alimentos em moléculas menores que podem ser absorvidas pela célula.