O Windows 98 não é compatível com computadores IBM ou Apple. O Windows 98 foi projetado especificamente para ser executado em computadores pessoais (PCs) que usam processadores Intel ou compatíveis. Os computadores IBM e Apple usavam processadores e arquiteturas diferentes, portanto o Windows 98 não podia ser instalado ou executado nesses computadores. Além disso, a IBM e a Apple tinham seus próprios sistemas operacionais, OS/2 e macOS respectivamente, que foram projetados para rodar exclusivamente em seus computadores.