O iTunes não funciona com qualquer reprodutor de MP3, ele foi projetado para funcionar apenas com dispositivos Apple, como iPhones, iPads, iPods, Apple TV e apenas alguns dispositivos autorizados.
O iTunes foi desenvolvido com integração específica para Apple Music, iCloud Music Library, iTunes Store para compra/aluguel de filmes/programas de TV ou compra e sincronização de mídia, como podcasts, que podem ser incompatíveis com players que não sejam da Apple.
Além disso, muitos tocadores de MP3 usam software proprietário para gerenciamento e sincronização de música.